La Asociación EMAN cuenta desde su fundación el 26 de mayo de 2020 con la siguiente Junta Directiva:
Presidenta: Arantxa Garatea Elzaburu
Secretario: Iñigo Oses Maestro
Tesorero: José María Lacunza Arraiza
Vocal: Jesús Soria Magaña
Vocal: Iñigo Laborería García
Vocal: David Aztarain de Luis
Vocal: Francisco Rodríguez Armenta
Vocal: Javier Muruzabal Domeño
Vocal: Anselmo Pinilla Martínez
Para un correcto funcionamiento la entidad dispone de un modelo organizativo basado en Comisiones de trabajo.